Episode 31 : Le pêché

Mustang et sa compagnie sont envoyés capturer Scar au camp de réfugiés, mais ils craignent une résistance des Ishbals.
Au QG sud, Armstrong et Archer sont stupéfaits de voir Kimblee en vie, censé exécuté. L'ancien alchimiste écarlate leur conseille de demander des explications au Généralissime qui surgit derrière eux. Izumi tente de s'enfuir mais est intercepté par Al. Le généralissime, d'une vitesse surprenante, prend l'enfant des bras du professeur et repart, couvert des attaques d'Izumi par Amrstrong. Ed et Al s'apprêtent  à intervenir mais la chimère-lézard et Kimblee les attaquent également.
Plus loin, Envy quitte l'apparence du Généralissime. Il contraint l'enfant à avaler des pierres rouges qui finit par les engloutir. Envy révèle lui alors que s'il peut dévorer ainsi ces pierres, faîtes de vie humaine, c'est un Homonculus.
Le lieutenant-colonel Archer propose à Kimblee de rejoindre l'armée.

Pendant que Ed et Al trouvent un commandant Armstrong soi-disant blessé, Izumi arpente les couloirs lorsque l'enfant se jette dans ses bras. Remarquant les nouvelles sangles rouges qu'il porte, elle regarde dans la salle et découvre le cadavre du prétendu Généralissime, avant de repartir.
De retour à la boutique de viande, les frères Elric interrogent Sig sur la destination de sa femme mais inutilement. Winry intervient et leur dit qu'elle est sans aucun doute retournée à l'île de Yokk, le lieu de sa transmutation humaine.
Arrivés sur l'île, ils trouvent l'Homonculus en train d'étrangler le professeur et l'arrêtent. Ed veut attaquer mais Izumi l'en empêche : des années plus tôt, voyant la créature qu'elle avait transmutée, elle avait préféré l'abandonner, désespérée, derrière cette porte qui était apparue. Elle sait que ce garçon ne peut être que son bébé, elle est seule fautive. Ed ne comprend pas, certain que la création des homonculus est semblable à celle de chimères, mais l'enfant lui révèle que les homonculus sont issus de transmutations humaines échouées par les alchimistes.

Greed et sa bande débarquent sur l'île mais Envy les surprend. Déçu que Greed se soit libéré, il entend bien retrouver le crâne pour le sceller de nouveau. Ils commencent à combattre mais Sloth arrive. Greed préfère prendre la fuite. Sloth rappelle alors à Envy, qui a pourtant envoyé Wrath attaquer Edward, qu'il leur faut celui-ci vivant. Mais Envy semble vouloir se venger du père de Edward.
Le garçon, dénommé donc Wrath par les autres Homonculus, se rappelle à présent : de la porte derrière laquelle il grandit des années durant, et lorsqu'il prit les deux membres du jeune Edward qui tentait de ramener son frère, et d'avoir enfin la force un jour d'ouvrir la porte et de se libérer.
Alors que Ed réalise enfin, Wrath annonce vouloir prendre le corps entier de Ed pour devenir un véritable humain et se jette sur lui. Alphonse s'interpose et, gravement, déclare être capable de lui reprendre les membres de Edward avant de se précipiter vers lui.